在過去10年中，微生物學(xué)領(lǐng)域已轉(zhuǎn)向全基因組序列研究，其中，位于馬里蘭州Rockville的基因組研究所（TIGR）在這一領(lǐng)域起了很大的作用，該所的科學(xué)家們公布了最早測得的三種微生物全基因組序列——流感嗜血菌、生殖道支原體和詹氏甲烷球菌。截至2004年1月，在已完成測序并公布的150多個基因組序列中，他們所公布的基因組序列有40多個。因此，借著這個令人鼓舞的機會，Humana出版公司計劃出一本關(guān)于該領(lǐng)域研究進展的書，各章作者中很多是我們基因組研究所的同事，也有來自世界各地的一些專家。

　　微生物基因組學(xué)是一個非常大的領(lǐng)域，當(dāng)選擇每一章的題目時，我們意識到，要么涵蓋較大范圍而對相關(guān)知識僅作初步介紹，要么把我們認為非常重要的一些問題深入討論，我們選擇了前者。我們希望《微生物基因組》-書能描述更廣的內(nèi)容，能使初涉這一領(lǐng)域的讀者和具有專業(yè)知識的人都對此書感興趣。作為主編，我們發(fā)現(xiàn)一些很有趣的事情，盡管題目各不相同，某些重復(fù)出現(xiàn)的主題卻貫穿全書，如基因水平轉(zhuǎn)移、比較基因組分析的重要性和基于微陣列的基因表達分析。

　　《微生物基因組》分為6個主要部分，為讓讀者更好地了解這一領(lǐng)域的發(fā)展，分出一部分介紹微生物基因組學(xué)歷史是十分必要的，所以主編委托Hamilton Smith準備這一介紹性文章�！白鳛榛�因組學(xué)工具的生物信息學(xué)”部分，提供了用于基因組學(xué)及其應(yīng)用的最常用的計算工具。“核心功能”部分介紹了每個微生物基因組都包括的微生物代謝、運輸和細胞循環(huán)等過程�！拔⑸�物基因組的進化”中，安排了一系列章節(jié)，目的是告訴大家，基因組學(xué)如何重建微生物世界的歷史和動態(tài)性。在“微生物基因組的調(diào)查”中，組織了一系列章節(jié)并有選擇性地論述了一些生物類群。盡管沒有涵蓋每種微生物基因組（而另一些種在多個章節(jié)中被描述），但我們的目的是提供一些從基因組研究可以獲得的生物信息。最后是“基因組數(shù)據(jù)庫的應(yīng)用”，這部分描述如何用基因組序列研究微生物中最重要的問題。值得一提的是，在本書撰寫期間，即2002年底到2003年初，許多尚未完成的基因組測序現(xiàn)已完成，感興趣的讀者可以訪問像基因組研究所數(shù)據(jù)庫這樣的網(wǎng)站，以便得到最新的信息。

　　如果沒有TrinaEacho女士的幫助，這本書不可能成功出版，她利用很多周末時間組織各個章節(jié)并形成初稿，主編們對她的諸多貢獻非常感激。

　　當(dāng)然，此書難免有疏漏之處，而且它也不能涵蓋所有的重要方面，我們希望著者們的集思廣益及各章節(jié)的內(nèi)容能給諸位讀者以啟發(fā)。微生物基因組學(xué)包括了進化與種群生物學(xué)、基因表達分析、蛋白質(zhì)組學(xué)以及很多與DNA序列相關(guān)的研究。毫不夸張地說，微生物基因組學(xué)跨越了微生物學(xué)科本身的廣度和深度。