普魯士—德意志帝國的君主同時也必須（至少理論上）是一個軍事指揮官。從威廉二世開始統(tǒng)治德意志帝國的那天起，他就把這方面的責任視為統(tǒng)治中非常重要的一個方面。在他登基的幾個星期之后，他就發(fā)布政令，宣布成立一個新的軍事機構，也就是我們所知的“皇帝與國王陛下的指揮部”（Headquarters of HisMajesty the Kaiser and King）。普魯士國王的軍事副手，從傳統(tǒng)上來講，都是作為各自服役的軍隊部門的代表來陪伴在皇帝左右的，然而與此不同的是，威廉二世的指揮部里的將軍和副官都是他在軍事內閣大臣的幫助下親自挑選出來的。在整個戰(zhàn)前時期，威廉二世都對軍備問題以及陸軍和海軍法規(guī)的起草有著非常狂熱的興趣，甚至十分渴望能夠指揮年度軍隊演習。那個被廣為流傳的用來形容德意志帝國皇帝的稱呼，“最高統(tǒng)帥”（ObersterKriegsherr），更是突出了德意志帝國君主對軍隊構建和部署的這份責任。

這位君主對維持和延伸越過議會的王室指揮權的決心，對德意志的政治與憲法歷史有著非常重大的影響（詳見第4 章）。它同樣也影響了陸軍與海軍指揮的結構演變。簡單地講，它阻滯了一個能夠協(xié)調各部門活動以及調整它們的優(yōu)先權的中心機構的形成。在威廉一世統(tǒng)治的時候，人事、訓練、軍備以及部署的責任逐漸被分散到一系列相互競爭的機構中去：總參謀部、戰(zhàn)爭部以及軍事內閣等。威廉二世并沒有試圖顛覆這種狀況，事實上他進一步分散了指揮機構，方式是增加可直接向皇帝匯報的陸軍及空軍指揮所的數(shù)量。這是一種有意識的策略，目的是為了創(chuàng)造出一個使君主的指揮權力不受限制的環(huán)境�！霸跊Q定親自行使對海軍以及陸軍的最高指揮權以后，”威廉二世在1899 年3 月14 日發(fā)布的政令中宣稱，“我認為這不實際，就是在我和我的將領之間需要有一個負責指揮的中央機構，而它的作用就是傳達我的命令�！�
然而，實際上威廉二世行使指揮權的能力是十分受限的。他對軍隊演習的參與，被證明是極具破壞性的，一部分原因是威廉二世并不擅長戰(zhàn)術謀略，還有一部分原因是總參謀長阿爾弗雷德•馮•施里芬認為，如果皇帝參與進來，那么他必須得在演習中獲勝：“因為皇帝不能被他的任何一位將領擊敗�！�1906 年，施里芬的繼任者赫爾穆特•馮•毛奇把威廉二世不再進一步介入指揮作為自己上任的條件。

威廉二世同樣也缺乏對戰(zhàn)略規(guī)劃的概念。在戰(zhàn)爭即將到來的時候，對于總參謀部制定的應對可能發(fā)生戰(zhàn)爭的策略，他也只被通知了個大概走向—比如，他知道施里芬計劃的大致情況。但是，他并不會被告知軍事規(guī)劃中的具體細節(jié)，這可能是因為非常注重保密的總參謀部認為他可能會泄露一些機密。此外，無論是陸軍和海軍內閣，還是帝國指揮部，都沒有資源來支持皇帝真正行使指揮權。德意志帝國并沒有像法國的戰(zhàn)爭高級委員會（Conseil Supérieure de la Guerre）或英國的帝國防務委員會之類的統(tǒng)一軍事指揮機構，而威廉二世并沒有能力在軍事指揮中扮演協(xié)調者的角色，因此也就無法彌補德意志帝國的這一缺失了。甚至是在戰(zhàn)爭爆發(fā)前的最后幾年里，德意志帝國領導層都沒有為海陸兩軍的聯(lián)合行動做出什么具體的準備，也沒有試圖使軍事規(guī)劃者所設想的策略和德意志帝國外交所追求的目標相吻合。從這層意義上說，德意志帝國依然屬于“戰(zhàn)略上無領導”。
在軍事指揮方面，就像其他很多方面一樣，皇帝所扮演的角色在理論上與現(xiàn)實上，可謂有著天壤之別。德意志憲法規(guī)定（第63 條）在戰(zhàn)爭爆發(fā)時，皇帝必須擁有所有地面部隊的最高指揮權，據(jù)說威廉二世曾宣布他會是“自己的戰(zhàn)時總參謀長”。如果他確實是這樣聲稱的，那么在1914 年8 月爆發(fā)的戰(zhàn)爭應該能成功打消他的錯覺；他立即正式把以他的名義下達行動指令的權力讓渡給了總參謀長。因此，總參謀長成了“真正擁有軍隊最高指揮權的人”。8 月初，威廉二世承諾，他不會干涉軍事行動的過程，令軍方領導層驚訝的是，他在整場戰(zhàn)爭中都恪守了這個承諾。這些將軍們，至少在戰(zhàn)爭初期的時候，都會留心不讓他知道一些來自前線的壞消息，可能是因為他們都知道他的斗志是多么易受影響。戰(zhàn)爭的爆發(fā)似乎把他拋入了神經衰弱的狀態(tài)，這種狀態(tài)一直延續(xù)到戰(zhàn)爭結束的時候—中間只有一些很短的時間他的狀態(tài)會好一點兒。勝利的傳言確實會讓威廉二世沉浸于嗜血的狂喜中，但是他也非常容易變得沮喪，還易于陷入會一陣陣發(fā)作的失敗主義情緒中。他的情緒隨著前線傳來的瞬息萬變的消息而起伏不定。比如，1916 年9 月6 日，據(jù)說威廉二世“看上去很糟”，因為他剛剛收到了關于第一近衛(wèi)軍團在索姆河戰(zhàn)況的令人擔憂的報告。但是，第二天他就又“非常興奮”了，因為他得知羅馬尼亞在圖特拉坎的堡壘失守了。