清政府為加強(qiáng)對臺灣的有效治理，以閩臺合治將臺灣納入福建地方治理之同時，自康熙六十年每年欽差滿、漢御史各一名到臺灣巡察，推行朝廷政令，反映臺灣地方輿情。至乾隆五十二年，共有47位御史先后巡臺，并留下了反映清政府直接管轄與有效治理臺灣的歷史文獻(xiàn)。本書以巡臺御史的巡臺文獻(xiàn)為整理與研究對象；從散見于清代官方檔案、地方志書，以及巡臺御史的文集中，搜集整理巡臺御史在巡臺期間留下的重要文獻(xiàn)。為研究者引用之便，我們按照文獻(xiàn)體裁分為四編：
　　第一編巡臺奏折。1980年代臺灣束海大學(xué)何孟興撰寫《清初巡臺御史制度之研究》時，在附錄“宮中檔巡臺御史奏折分類表”中，共列出巡臺御史奏折一百七十五份，并認(rèn)為“其它多已佚散”。本編共收錄巡臺御史巡臺奏折二百三十八份。按奏折之功能分為三卷：第一卷奏事折，二百一十九份；第二卷請安折，四份；第三卷謝恩折，七份；另有八份奏折因無法辨清，暫列為存目。需特別指出的是，以上所列二百三十八份奏折，其中九十份是從九州島出版社剛剛出版的《明清宮藏臺灣檔案匯編》中整理而成，僅此窺見《明清宮藏臺灣檔案匯編》的出版，為如實(shí)追記中央政府對臺灣的有效管轄，提供了更為系統(tǒng)完整的史料依據(jù)。為讀者閱讀之便，我們將莊吉發(fā)《清代奏折制度.緒論》附列于后。
　　第二編巡臺著述。收錄黃叔礅《臺海使槎錄》和六十七等人《番社采風(fēng)圖考》兩部。第一卷為黃叔墩《臺海使槎錄》，第二卷為六十七等人《番社采風(fēng)圖考》�？紤]到巡臺御史的詩集大部分并非巡臺期間所[作，故未能作為巡臺著述收錄。