當(dāng)年學(xué)習(xí)生物統(tǒng)計(jì)的時(shí)候，感覺這門課很不好學(xué)，后來在開發(fā)農(nóng)博士育種家軟件的時(shí)候，一個(gè)算法一個(gè)算法的編程實(shí)現(xiàn)，需要掌握每個(gè)算法的實(shí)現(xiàn)步驟和原理，不得不重新學(xué)習(xí)生物統(tǒng)計(jì)、數(shù)量遺傳學(xué)這些課程。由于育種新技術(shù)新方法的不斷出現(xiàn)，需要不斷跟蹤研究算法，接觸了不少國內(nèi)外相關(guān)教材，包括生物統(tǒng)計(jì)學(xué)、數(shù)量遺傳學(xué)、生物信息學(xué)、遺傳學(xué)、玉米育種學(xué)、動(dòng)物育種學(xué)、分子育種學(xué)等。然后，發(fā)現(xiàn)了一些問題，有了一些個(gè)人的想法。
　　從效應(yīng)的角度學(xué)習(xí)理解方差分析，會(huì)生動(dòng)許多。方差分析三句話簡單易用。
　　透過分子育種，可以找尋常規(guī)育種的不足和可提升改進(jìn)之處。分子育種領(lǐng)域注重育種值而不是配合力、“配合力幻想”“配合力有作為經(jīng)營策略的一面”，這些都會(huì)促使植物育種者重新認(rèn)識(shí)配合力。植物育種，配合力可以用，但有不足，育種值要會(huì)用。動(dòng)物育種實(shí)踐已經(jīng)證明了依據(jù)育種值選擇的有效性，動(dòng)物育種學(xué)中分量很重的內(nèi)容就是BLUP育種值計(jì)算，為育種選擇提供了明確而重要的數(shù)學(xué)理論和方法，而植物育種學(xué)中一直未涉及這方面的內(nèi)容，動(dòng)、植物育種選擇在基因?qū)用娌粦?yīng)該存在差別，長期形成的植物育種用配合力、動(dòng)物育種用育種值的局面將會(huì)改變。分子育種時(shí)代，植物育種將難覓配合力的身影，傳統(tǒng)植物育種選擇技術(shù)需要提升科學(xué)技術(shù)含量。
　　BLUP在植物育種領(lǐng)域使用，從數(shù)據(jù)模型角度，更適合與育種值結(jié)合，北京中農(nóng)博思科技發(fā)展有限公司據(jù)此提出了植物育種適合采用的植物育種值模型（BS模型），這與動(dòng)物育種采用的動(dòng)物模型、公畜模型等諸多線性模型本質(zhì)上是一致的。不適合將BLUP應(yīng)用于一般配合力和特殊配合力分析，因?yàn)槟Ｐ椭心甓取⒌攸c(diǎn)等效應(yīng)沒有分離，模型生物學(xué)意義不明晰。
　　植物育種中常見的缺區(qū)現(xiàn)象，本書給出了新的系列應(yīng)對(duì)策略。缺區(qū)，并沒有影響試驗(yàn)材料的客觀試驗(yàn)表現(xiàn)，需要進(jìn)行相應(yīng)的平方和和自由度計(jì)算調(diào)整。缺幾個(gè)自由度就減幾個(gè)，平方和采用累加的思路，缺了就不累加，試驗(yàn)分析參數(shù)進(jìn)行對(duì)應(yīng)調(diào)整，跟未缺區(qū)的時(shí)候一樣分析。如果缺區(qū)導(dǎo)致試驗(yàn)中某效應(yīng)的平均數(shù)無法計(jì)算，那就不能進(jìn)行方差分析，這可以作為缺區(qū)情況下是否能夠進(jìn)行方差分析的一個(gè)判斷依據(jù)。該系列策略在跟SAS軟件的比較計(jì)算中得到了印證。
　　品種穩(wěn)定性包含了穩(wěn)定性和適宜性兩個(gè)方面，用相對(duì)平均偏差解決品種穩(wěn)定性非常實(shí)用，穩(wěn)定性分析方法太多了，以至于不少人忽略了樣本間穩(wěn)定性比較的基本統(tǒng)計(jì)量RSD；分子育種時(shí)代已經(jīng)到來，很多新技術(shù)新方法還是圍繞育種選擇在發(fā)力，育種的核心是選擇，選擇的最終指向是有利基因的聚合。
　　從育種選擇的角度，離差（效應(yīng)）更有選擇指向性、更實(shí)用，方差在生物統(tǒng)計(jì)中很重要，在育種中則沒有那么重要，要了解育種何時(shí)需要用方差，了解方差的育種價(jià)值。不完全區(qū)組試驗(yàn)設(shè)計(jì)會(huì)被越來越多的國內(nèi)育種工作采用，立足自身育種實(shí)際，腳踏實(shí)地，穩(wěn)步提升育種統(tǒng)計(jì)應(yīng)用水平更穩(wěn)妥。育種軟件日漸成為育種工作必備工具，專業(yè)育種數(shù)據(jù)分析很多是手工計(jì)算難以實(shí)現(xiàn)的工作，國內(nèi)育種工作者要從思想上認(rèn)識(shí)到?jīng)]有數(shù)學(xué)支撐的育種是走不遠(yuǎn)的。全基因組選擇，動(dòng)輒幾萬到幾十萬個(gè)SNP標(biāo)記效應(yīng)的分析計(jì)算，沒有軟件，什么都做不了。
　　植物遺傳育種專業(yè)可以考慮從育種與統(tǒng)計(jì)、數(shù)量遺傳學(xué)應(yīng)用結(jié)合的角度，講授育種中常用的對(duì)比法、間比法、單因素隨機(jī)完全區(qū)組、配合力、育種值等相關(guān)統(tǒng)計(jì)知識(shí)。一本專業(yè)的生物統(tǒng)計(jì)教材，沒有結(jié)合專業(yè)需要梳理知識(shí)側(cè)重，對(duì)學(xué)生來說注定學(xué)得不清不楚、糊里糊涂，工作中束手束腳.反而束縛了統(tǒng)計(jì)的農(nóng)業(yè)應(yīng)用。
　　植物育種在數(shù)量遺傳學(xué)應(yīng)用方面需要提升，跟動(dòng)物育種長期存在差距。業(yè)內(nèi)一位知名的玉米育種專家前輩，當(dāng)年就是不得不去學(xué)習(xí)動(dòng)物數(shù)量遺傳學(xué)課程來補(bǔ)充植物育種知識(shí)，今天從教材方面看依然是這個(gè)情況。
　　本書專注研究生物統(tǒng)計(jì)、數(shù)量遺傳學(xué)、生物信息學(xué)跟育種的應(yīng)用結(jié)合，研究適合實(shí)際育種使用的育種理論和分析方法。本書不是一本生物統(tǒng)計(jì)入門教材，如果您學(xué)習(xí)完生物統(tǒng)計(jì)感到困惑或者學(xué)習(xí)完數(shù)量遺傳學(xué)不知道如何跟實(shí)際育種工作結(jié)合，這本書應(yīng)該對(duì)您有幫助。
　　由于水平有限，內(nèi)容和觀點(diǎn)難免存在錯(cuò)誤和不足之處，希望讀者不吝賜教。