故事發(fā)生在19世紀(jì)上半葉美國(guó)密西西比河畔的一個(gè)普通小鎮(zhèn)上。湯姆·索亞是個(gè)調(diào)皮的孩子，他和同父異母的弟弟一起接受姨媽波莉的監(jiān)護(hù)。他總是能想出各種各樣的惡作劇，讓波莉姨媽無(wú)可奈何，而他也總能想盡辦法來躲避懲罰。一天，湯姆見到了可愛的姑娘蓓姬·撒切爾，她是撒切爾法官的女兒。湯姆一見到她就對(duì)她展開了攻勢(shì)。而他的愛似乎也得到了回應(yīng)。
鎮(zhèn)上有一個(gè)孩子叫哈克貝利·費(fèi)恩。他的父親總是酗酒，父母一直打架，因此他跑出來自己生活。他看起來和文明社會(huì)格格不入，大人們都不喜歡他，可湯姆和他卻是好朋友。
一日半夜，湯姆和哈克去墳地“試驗(yàn)”用死貓治疣子的方法時(shí)，意外地遇上了一場(chǎng)謀殺案——去盜尸的羅賓遜大夫、印第安人喬和酒鬼波特三個(gè)人發(fā)生爭(zhēng)執(zhí)，一怒之下，喬把大夫殺了，并把殺人罪賴到了被打暈的波特身上。當(dāng)時(shí)嚇得夠嗆的湯姆和哈克發(fā)誓，要對(duì)此事嚴(yán)守秘密。但湯姆在很長(zhǎng)時(shí)間內(nèi)一直陷于不安之中。
后來，湯姆由于和蓓姬慪氣而與好友一起離家出走，湯姆、喬·哈波和哈克一起坐筏子到一個(gè)小島上去當(dāng)“海盜”。鎮(zhèn)上的人不知道他們的去向，以為他們?cè)诤永镅退懒�。在為他們舉行葬禮的那天，他們?nèi)�人卻“奇跡般”地出現(xiàn)了。湯姆成了學(xué)校里的英雄。蓓姬也在不久之后與他重歸于好……
不久后，法院終于要審理那樁兇殺案——大家都以為兇手是波特時(shí)，湯姆克服恐懼，告發(fā)了印第安人喬，但喬卻當(dāng)場(chǎng)逃走了。湯姆陷入了極度不安之中。
后來，湯姆和哈克去一個(gè)鬼屋“尋找海盜埋藏的財(cái)寶”的時(shí)候，發(fā)現(xiàn)喬裝的印第安人喬和一個(gè)同伙在鬼屋中找到了一部分財(cái)寶，并且偷聽到有一個(gè)“二號(hào)”——另一個(gè)藏寶藏的地方。他們決定找到“二號(hào)”。
幾天后，蓓姬、湯姆和一些其他朋友去“野餐會(huì)”，他們來到了麥克杜格爾洞——一個(gè)迷宮般的巖洞里玩。湯姆和蓓姬光顧著玩耍，脫離了大伙兒，迷路了。他們?cè)诙蠢餁v盡波折，饑餓、干渴、黑暗和恐懼不斷襲擊著無(wú)助的他們。過了好幾天，他們也沒找到出路。更可怕的是，他們?cè)诙粗锌匆娏擞〉诎踩藛獭��?br> 鎮(zhèn)上的人們都以為他們死在洞中了，波莉姨媽和撒切爾一家都悲痛極了。直到一天半夜——鎮(zhèn)上突然喧鬧起來——湯姆和蓓姬被找到了！原來，湯姆牽著綁在石頭上的風(fēng)箏線探路，終于找到了一個(gè)出口，最后被幾個(gè)好心人送了回來。
由于這件事，洞口被封了。湯姆知道后，便把印第安人喬在洞里的事告訴了蓓姬的爸爸撒切爾法官。法官便帶人去查看，洞門被打開了，但喬早就餓死了。
后來，湯姆經(jīng)過分析，判定寶藏已經(jīng)被印第安人喬藏到巖洞中了。于是他和哈克偷偷地潛入到巖洞中，并根據(jù)他們偷聽到的關(guān)于“二號(hào)”的描述，找到了一個(gè)寶箱——里面有一萬(wàn)兩千余美元！發(fā)現(xiàn)寶藏的他們成了大富翁。
從此以后，湯姆和哈克變成了小鎮(zhèn)上的“風(fēng)云人物”，不僅走到哪兒都會(huì)受到歡迎，而且他們倆的小傳還登在了鎮(zhèn)報(bào)上。