實(shí)用數(shù)量生態(tài)學(xué)
數(shù)量生態(tài)學(xué)是指利用數(shù)學(xué)分析方法定量研究和解決生態(tài)問題的一門課程,是生態(tài)學(xué)方向研究生的一門專業(yè)必修課。針對(duì)生態(tài)學(xué)研究中常用的方法,《實(shí)用數(shù)量生態(tài)學(xué)》進(jìn)行了詳細(xì)介紹,并給出了極其詳細(xì)的案例計(jì)算!秾(shí)用數(shù)量生態(tài)學(xué)》分為七個(gè)章節(jié),包括數(shù)據(jù)整理與準(zhǔn)備、多樣性指數(shù)計(jì)算、種間關(guān)系分析、生態(tài)位、空間格局分析、排序、群落數(shù)量分類方法等。在介紹完具體計(jì)算原理與實(shí)例后,還為分析方法提供了標(biāo)準(zhǔn)化的通用MATLAB 語(yǔ)言源程序,供探究細(xì)節(jié)的讀者研習(xí)使用。
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目錄
前言
第一章 數(shù)據(jù)整理與準(zhǔn)備 1
第一節(jié) 數(shù)據(jù)的類型 1
一、名稱數(shù)據(jù) 1
二、順序?qū)傩詳?shù)據(jù) 2
三、數(shù)量屬性數(shù)據(jù) 3
第二節(jié) 數(shù)據(jù)預(yù)處理 3
一、數(shù)據(jù)簡(jiǎn)縮 4
二、數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換 4
三、數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化 6
第三節(jié) 預(yù)處理的MATLAB實(shí)現(xiàn) 14
一、MakeExcelFileName函數(shù) 14
二、MakeExcelColumnName函數(shù) 15
三、OutputExcel函數(shù) 16
四、DataTransform函數(shù) 17
五、StandardizeData函數(shù) 19
第二章 多樣性指數(shù)計(jì)算 25
第一節(jié) 物種多樣性指數(shù) 25
一、α多樣性指數(shù) 25
二、α多樣性計(jì)算的MATLAB實(shí)現(xiàn) 31
三、β多樣性指數(shù) 37
第二節(jié) 系統(tǒng)發(fā)育多樣性 40
一、群落系統(tǒng)發(fā)育α多樣性指數(shù) 40
二、群落系統(tǒng)發(fā)育β多樣性指數(shù) 42
第三節(jié) 功能多樣性 44
一、功能α多樣性指數(shù) 45
二、功能β多樣性指數(shù) 47
第三章 種間關(guān)系分析 49
第一節(jié) 種間關(guān)聯(lián) 49
一、總體關(guān)聯(lián)性分析 49
二、種對(duì)間關(guān)聯(lián)性分析 51
三、種間關(guān)聯(lián)計(jì)算的MATLAB實(shí)現(xiàn) 54
第二節(jié) 種間相關(guān) 61
一、Pearson相關(guān)系數(shù) 61
二、Spearman相關(guān)系數(shù) 63
第三節(jié) 種間分離 65
一、Pielou分離指數(shù) 66
二、Pielou分離指數(shù)的MATLAB實(shí)現(xiàn) 68
第四節(jié) 種間競(jìng)爭(zhēng) 71
一、競(jìng)爭(zhēng)強(qiáng)度 71
二、競(jìng)爭(zhēng)指數(shù)的MATLAB實(shí)現(xiàn) 72
第四章 生態(tài)位 74
第一節(jié) 生態(tài)位測(cè)度計(jì)算 75
一、生態(tài)位寬度計(jì)算 75
二、生態(tài)位重疊指數(shù) 77
三、生態(tài)位分離 85
四、多物種生態(tài)位重疊指數(shù) 85
五、生態(tài)位重疊的應(yīng)用 85
第二節(jié) 生態(tài)位計(jì)算的MATLAB實(shí)現(xiàn) 86
一、niche函數(shù) 86
二、WangOverlap函數(shù) 90
三、nobp函數(shù) 92
第五章 空間格局分析 93
第一節(jié) 種群分布類型及其判定 93
一、植物分布類型與模型描述 93
二、分布格局類型的驗(yàn)證 94
第二節(jié) 單種群格局規(guī)模分析 103
一、等級(jí)方差分析法 104
二、雙項(xiàng)軌跡方差法 108
三、隨機(jī)配對(duì)法 112
第三節(jié) 單種群格局紋理分析 118
一、斑塊-間隙分析法 118
第四節(jié) 大尺度格局分析 123
一、趨勢(shì)面分析 123
二、典范趨勢(shì)面分析 131
第六章 排序 147
第一節(jié) 極點(diǎn)排序法 148
一、步驟 148
二、實(shí)例計(jì)算 149
三、極點(diǎn)排序法的MATLAB實(shí)現(xiàn) 151
第二節(jié) 主成分分析法 155
一、主成分分析概述 155
二、主成分分析排序步驟 156
三、實(shí)例計(jì)算 157
四、主成分分析的MATLAB實(shí)現(xiàn) 160
第三節(jié) 典范主成分分析法 164
一、原理與步驟 164
二、實(shí)例計(jì)算 165
三、典范主成分排序的MATLAB實(shí)現(xiàn) 168
第四節(jié) 主坐標(biāo)分析法 171
一、原理與步驟 171
二、實(shí)例計(jì)算 173
三、主坐標(biāo)分析的MATLAB實(shí)現(xiàn) 174
第五節(jié) 對(duì)應(yīng)分析法 178
一、原理與步驟 178
二、實(shí)例計(jì)算 179
三、對(duì)應(yīng)分析排序的MATLAB實(shí)現(xiàn) 181
第六節(jié) 修訂型對(duì)應(yīng)分析法 186
一、原理與步驟 186
二、實(shí)例計(jì)算 187
三、修訂型CA/RA排序的MATLAB實(shí)現(xiàn) 190
第七節(jié) 除趨勢(shì)對(duì)應(yīng)分析法 193
一、原理與步驟 193
二、實(shí)例計(jì)算 194
三、除趨勢(shì)對(duì)應(yīng)分析的MATLAB實(shí)現(xiàn) 196
第八節(jié) 典范對(duì)應(yīng)分析法 200
一、原理與步驟 200
二、實(shí)例計(jì)算 202
三、典范對(duì)應(yīng)分析的MATLAB實(shí)現(xiàn) 206
第九節(jié) 除趨勢(shì)典范對(duì)應(yīng)分析法 213
一、原理與步驟 213
二、實(shí)例計(jì)算 213
三、除趨勢(shì)典范對(duì)應(yīng)分析的MATLAB實(shí)現(xiàn) 216
第七章 群落數(shù)量分類 222
第一節(jié) 相似的表達(dá)方法 222
一、僅適用于二元數(shù)據(jù)的相似關(guān)系 223
二、適用于二元數(shù)據(jù)和數(shù)量數(shù)據(jù)的相似關(guān)系 230
第二節(jié) 等級(jí)聚類法 235
一、等級(jí)聚類方法的步驟 235
二、幾種常用的聚合策略 238
三、等級(jí)聚類分析的MATLAB實(shí)現(xiàn) 240
第三節(jié) 關(guān)聯(lián)分析法 243
一、原理與步驟 243
二、實(shí)例計(jì)算 244
三、關(guān)聯(lián)分析法的MATLAB實(shí)現(xiàn) 248
第四節(jié) 雙向指示種分析法 254
一、原理與步驟 254
二、實(shí)例計(jì)算 255
三、雙向指示種分析法的MATLAB實(shí)現(xiàn) 260
主要參考文獻(xiàn) 272