第2版前言
第1版前言
第1章 緒論
1.1 生物信息學(xué)的概念及研究對象
1.2 生物信息學(xué)的研究內(nèi)容
1.3 生物信息學(xué)的應(yīng)用
第2章 生物信息數(shù)據(jù)庫
2.1 生物信息數(shù)據(jù)庫的發(fā)展簡史
2.2 核酸序列數(shù)據(jù)庫
2.3 蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫
2.4 生物大分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫
2.5 基因功能注釋數(shù)據(jù)庫
2.6 其他生物分子數(shù)據(jù)庫
第3章 數(shù)據(jù)庫查詢
3.1 NCBI查詢系統(tǒng)Entrez
3.2 基因組數(shù)據(jù)庫Ensembl
3.3 蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)厙UniProt
第4章 序列比對與數(shù)據(jù)庫相似性搜索
4.1 概述
4.2 序列比對的打分系統(tǒng)
4.3 序列比對的算法
4.4 雙序列比對及基本操作
4.5 多序列比對及基本操作
4.6 數(shù)據(jù)庫相似性搜索——BLAST
第5章 DNA序列分析
5.1 核酸序列組成成分分析
5.2 限制性內(nèi)切酶酶切位點分析
5.3 重復(fù)序列分析
5.4 基因結(jié)構(gòu)分析
5.5 序列同源性分析
第6章 蛋白質(zhì)序列分析
6.1 蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)分析
6.2 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)分析
6.3 蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)分析
6.4 蛋白質(zhì)功能預(yù)測
第7章 生物信息學(xué)軟件及使用
7.1 引物設(shè)計軟件
7.2 綜合序列分析軟件
第8章 R與Bioconductor
8.1 Bioconductor簡介
8.2 Bioconductor包的安裝
8.3 Bioconductor包應(yīng)用舉例
第9章 GEO2R
第10章 富集分析
10.1 DAVID簡介
10.2 DAVID富集分析
第11章 文獻(xiàn)信息檢索
11.1 學(xué)術(shù)搜索引擎
11.2 文摘數(shù)據(jù)庫檢索
11.3 全文數(shù)據(jù)庫檢索
11.4 Web of Science引文數(shù)據(jù)庫
第12章 EndNote20參考文獻(xiàn)管理軟件
12.1 EndNote20的主要功能
12.2 EndNote20數(shù)據(jù)庫的建立
12.3 EndNote數(shù)據(jù)庫的管理
12.4 EndNote數(shù)據(jù)庫的應(yīng)用
參考文獻(xiàn)
附錄 Windows環(huán)境下R與RStudio的安裝