本書對微生物學(xué)史，尤其是對科赫和弗萊克做了詳細(xì)研究，總結(jié)出了微生物學(xué)發(fā)展的四個(gè)特點(diǎn)：以技術(shù)發(fā)展為動力，以問題為導(dǎo)向，以證實(shí)原則為基礎(chǔ)，從還原論到整體論。并以此為基礎(chǔ)，提出了微生物學(xué)發(fā)展過程中形成的三種實(shí)證主義：樸素實(shí)證主義、還原論實(shí)證主義和整體論實(shí)證主義。顯微鏡發(fā)明之前和之初，人們通過簡單的觀察和實(shí)驗(yàn)，反駁或者證明關(guān)于宏觀現(xiàn)象的理論的做法，謂之樸素實(shí)證主義；隨著顯微鏡技術(shù)的改進(jìn)，人們不斷排除其他因素，最終將細(xì)菌視為疾病的病因，這種將宏觀現(xiàn)象還原為微觀現(xiàn)象，將復(fù)雜現(xiàn)象還原為單一要素的觀念，謂之還原論實(shí)證主義；隨著人們認(rèn)識到了科學(xué)的社會性和歷史性，在討論各種宏觀現(xiàn)象時(shí)，人們不僅要以實(shí)驗(yàn)室中得出的科學(xué)知識為基礎(chǔ)，而且還要將社會、歷史、政治等要素再次納入考慮之中，謂之整體論實(shí)證主義。