染色質是生命的基本物質基礎。本書內容主要涵蓋了染色質的基本特性、核小體組裝和解聚的調控，以及染色質上組蛋白的翻譯后修飾對染色質結構的影響并發(fā)揮多樣性的功能，特別是在轉錄調控、異染色質形成、DNA修復和DNA復制中的作用，最后介紹了染色質與其他細胞生理活動的功能聯系。這些表觀遺傳學調控對于研究生命現象、理解人類疾病的發(fā)生和演進、鑒定疾病治療的靶標和干預藥物的開發(fā)等至關重要。
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目錄
第1章 組蛋白、核小體和染色質結構 1
1.1 染色質結構簡介 1
1.2 染色質結構研究歷史 3
1.3 核小體核心顆粒結構 4
1.4 連接組蛋白和染色質小體 16
1.5 染色質的高級結構 16
1.6 展望 19
致謝 19
參考文獻 19
第2章 在染色質組裝和解聚中的組蛋白分子伴侶 25
2.1 簡介 25
2.2 組蛋白從細胞質到細胞核的轉運 29
2.3 復制依賴性染色質組裝 31
2.4 著絲粒染色質的重新組裝 36
2.5 組蛋白分子伴侶與復制非依賴性染色質解聚和組裝 39
2.6 DNA修復過程中染色質組裝和解聚中的組蛋白分子伴侶 44
2.7 結束語 46
參考文獻 46
第3章 染色質重塑復合物 57
3.1 簡介 57
3.2 重塑因子分類 60
3.3 重塑機制和調控 73
3.4 重塑因子在特定染色體加工中的功能 82
3.5 參與細胞多能性、發(fā)育和分化調節(jié)的重塑因子 93
3.6 重塑因子與癌癥 99
3.7 染色質重塑因子和疾病綜合征 102
參考文獻 104
第4章 組蛋白乙�；瘜θ旧|的調節(jié) 124
4.1 簡介 125
4.2 組蛋白乙酰轉移酶及其復合物 127
4.3 組蛋白去乙�；� 133
iv 染色質基礎與表觀遺傳學調控
4.4 乙�；K閱讀器 137
4.5 組蛋白乙�；瘜θ旧|/核小體結構的影響 138
4.6 組蛋白乙�；诮M蛋白沉積和染色質組裝中的作用 139
4.7 組蛋白乙�；诨虮磉_調控中的功能 142
4.8 DNA 修復中組蛋白乙�；淖饔� 146
4.9 酶相互作用調節(jié)組蛋白乙�；芭c其他修飾的串擾 149
4.10 組蛋白乙�；c人類疾病和藥物靶標的出現 151
4.11 展望：組蛋白乙酰化與細胞代謝之間的聯系 154
致謝 155
參考文獻 155
第5章 染色質信號轉導中的組蛋白甲基化 182
5.1 簡介 182
5.2 組蛋白甲基化：歷史的視角 185
5.3 組蛋白賴氨酸甲基化信號傳遞 186
5.4 組蛋白甲基化和DNA甲基化 203
5.5 組蛋白甲基化和腫瘤 205
5.6 組蛋白精氨酸甲基化 207
致謝 208
參考文獻 209
第6章 組蛋白泛素化調控基因表達 220
6.1 泛素化是一種可逆的翻譯后修飾 221
6.2 組蛋白的泛素化修飾 222
6.3 特異性E2/E3酶催化組蛋白單泛素化 224
6.4 組蛋白的單泛素化可以被去泛素化酶逆轉 231
6.5 組蛋白單泛素化調控基因轉錄 233
6.6 組蛋白泛素化和DNA修復 248
6.7 組蛋白單泛素化調控細胞周期 253
6.8 結論 253
參考文獻 254
第7章 PARP-1和ADP-核糖基化對染色質結構和功能的調控 262
7.1 簡介 262
7.2 PARP-1、聚ADP-核糖基化和PARP家族 262
7.3 PARP-1對染色質結構和基因表達的調控 266
7.4 PARP-1在異染色質中的功能 274
7.5 PARP-1定位和染色質活性的調節(jié) 276
7.6 總結和結論 281
參考文獻 281
第8章 組蛋白磷酸化和染色質動力學 287
8.1 簡介 287
8.2 組蛋白H1磷酸化 288
8.3 組蛋白H3磷酸化 290
8.4 組蛋白H2A磷酸化 291
8.5 閱讀器蛋白翻譯組蛋白修飾 294
8.6 結論和展望 294
參考文獻 295
第9章 組蛋白修飾的讀取 299
9.1 簡介 299
9.2 組蛋白修飾模塊的讀取 302
9.3 讀取方法 303
9.4 讀取的特異性 306
9.5 讀取組蛋白修飾的功能效果 307
9.6 展望 310
致謝 311
參考文獻 311
第10章 組蛋白變體的性質和功能 316
10.1 簡介 316
10.2 組蛋白變體的特征 321
10.3 組蛋白變體在DNA上的沉積 324
10.4 組蛋白變體的重要性 331
參考文獻 344
第11章 染色質的轉錄 361
11.1 簡介 361
11.2 轉錄周期 362
11.3 基因上的染色質結構 370
11.4 轉錄相關的轉錄后修飾 371
11.5 轉錄中的染色質重塑 380
11.6 延伸過程的組蛋白動力學 384
11.7 調控延伸過程的組蛋白動力學 385
11.8 非編碼轉錄：調節(jié)和結果 389
11.9 結論 391
參考文獻 392
第12章 DNA修復和復制過程中的染色質重塑 416
12.1 簡介 416
12.2 DNA 雙鏈損傷修復中的染色質重塑 416
12.3 DNA復制過程中的染色質重塑 434
12.4 結束語 438
參考文獻 438
第13章 異染色質：基因組的重要成分 447
13.1 為什么研究異染色質? 448
13.2 異染色質的構成 449
13.3 異染色質組裝 453
13.4 異染色質的遺傳剖析 454
13.5 異染色質形成：RNAi的作用 456
13.6 核組織動力學 458
13.7 異染色質與疾病 460
13.8 異染色質的未解之謎 461
參考文獻 461
第14章 染色質研究新興領域 468
14.1 細胞信號的重要性 468
14.2 染色質接受應激活化蛋白激酶的信號 468
14.3 應激信號、S期進展和轉錄相關重組 470
14.4 非編碼RNA參與表觀遺傳調控 470
14.5 細胞代謝對組蛋白修飾的影響 473
14.6 生物鐘中組蛋白修飾的波動 476
14.7 DNA甲基化決定細胞類型的特異性 477
14.8 表觀遺傳學和衰老 478
14.9 結論和展望 479
致謝 479
參考文獻 479
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