過去，在名為冬木的城市里，七位魔術(shù)師和七位英靈進(jìn)行了圣杯戰(zhàn)爭。但是，某位魔術(shù)師卻趁著世界大亂，強(qiáng)行奪走了圣杯。

數(shù)十年后，尤格多米雷尼亞一族以該圣杯為旗號，宣布叛離魔術(shù)協(xié)會，成為獨(dú)立組織。魔術(shù)協(xié)會憤而派出刺客，卻被尤格多米雷尼亞一族召喚的從者反擊。

以從者對抗從者，圣杯戰(zhàn)爭的系統(tǒng)發(fā)生變更，的七對七圣杯大戰(zhàn)爆發(fā)。

與此同時，第十五位從者貞德也被召喚為圣杯大戰(zhàn)的裁判。她也不知道自己為什么會被召喚，帶著疑惑動身前往故事的舞臺圖利法斯……

這是一個與Fate/stay night和Fate/Zero不同的全新Fate世界，圣杯大戰(zhàn)就此開幕!