定 價：69.8 元
叢書名：工業(yè)和信息化部"十四五"規(guī)劃教材
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- 作者：張巖
- 出版時間：2023/11/1
- ISBN：9787030761194
- 出 版 社：科學出版社
- 中圖法分類：Q7
- 頁碼：272
- 紙張：
- 版次：31
- 開本：16
本書是一本專門針對計算生物學領域的系統(tǒng)性教材，通過本教材的學習，可以掌握多種組學數(shù)據(jù)分析的原理和方法，包括高通量數(shù)據(jù)分析和單細胞測序數(shù)據(jù)的分析（第一章、第二章）、蛋白質組學及其功能預測（第三章）、計算表觀遺傳學（第五章）。在計算生物學的多學科應用上，本教材涵蓋了分子進化的計算生物學分析（第四章）、計算癌癥生物學（第六章）、計算免疫學（第七章）、藥物設計的計算方法和應用（第八章）、影像組學與人工智能（第九章）、基因編輯系統(tǒng)的識別與功能分析（第十章）等應用內(nèi)容，使讀者能夠掌握常用的基本算法、模型，從廣度和深度突出解決生物學領域的計算需求。同時，在第十一章介紹了計算生物學領域的大數(shù)據(jù)資源及工具。
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目錄
前言
緒論 1
第一節(jié) 計算生物學的起源和研究內(nèi)容 1
第二節(jié) 計算生物學的數(shù)學、統(tǒng)計學基礎2
第三節(jié) 計算機科學基礎 7
本章小結 15
第一章 高通量數(shù)據(jù)分析 16
第一節(jié) 基因組組裝 16
第二節(jié) 基因變異檢測 19
第三節(jié) RNA測序分析的基本方法 25
第四節(jié) 基因的注釋 34
第五節(jié) 差異表達基因的篩選 36
第六節(jié) 基因功能的富集分析 39
本章小結 44
第二章 單細胞測序數(shù)據(jù)的分析 46
第一節(jié) 單細胞測序技術 46
第二節(jié) 單細胞轉錄組數(shù)據(jù)預處理 52
第三節(jié) 單細胞轉錄組數(shù)據(jù)分析方法 56
案例分析：單細胞轉錄組數(shù)據(jù)聚類分析61
本章小結 62
第三章 蛋白質組學及其功能預測 64
第一節(jié) 蛋白質組學概述 64
第二節(jié) 蛋白質結構預測 70
第三節(jié) 蛋白質功能預測 74
案例分析：蛋白質二級結構預測 80
本章小結 83
第四章 分子進化的計算生物學分析 85
第一節(jié) 分子進化的基本概念 85
第二節(jié) 系統(tǒng)發(fā)育樹的構建 91
第三節(jié) 系統(tǒng)發(fā)育樹的應用 102
案例分析：基于全基因組序列的新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）多算法系統(tǒng)發(fā)育樹分析 104
本章小結 106
第五章 計算表觀遺傳學 108
第一節(jié) 基因組的DNA甲基化及數(shù)據(jù)分析 108
第二節(jié) 組蛋白修飾及數(shù)據(jù)分析 120
本章小結 127
第六章 計算癌癥生物學 128
第一節(jié) 癌癥生物標記亞型鑒定方法 128
第二節(jié) 癌癥預警和風險評估模型 136
第三節(jié) 癌癥個性化治療 142
本章小結 145
第七章 計算免疫學 146
第一節(jié) 計算免疫學概述 146
第二節(jié) 腫瘤免疫浸潤分析方法 148
第三節(jié) 腫瘤抗原鑒定的計算 156
第四節(jié) T細胞受體的分析 164
案例分析：免疫細胞浸潤算法工具的實踐 167
本章小結 182
第八章 藥物設計的計算方法和應用 184
第一節(jié) 藥物性質計算 184
第二節(jié) 藥物設計方法 191
第三節(jié) 精準用藥 204
本章小結 206
第九章 影像組學與人工智能 208
第一節(jié) 影像組學 208
第二節(jié) 影像組學的分析方法 213
案例分析：構建卷積神經(jīng)網(wǎng)絡進行圖片分類預測 223
本章小結 224
第十章 基因編輯系統(tǒng)的識別與功能分析 226
第一節(jié) 基因編輯系統(tǒng)概述 226
第二節(jié) 基因編輯技術的發(fā)展歷程 226
第三節(jié) 基因編輯工具 229
本章小結 233
第十一章 大數(shù)據(jù)資源及工具 234
第一節(jié) 大型測序數(shù)據(jù)庫 234
第二節(jié) 數(shù)據(jù)分析在線資源 250
本章小結 261
主要參考文獻 262
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