《物理學哲學研究》內容包括新解近代科學革命：從伽利略、笛卡爾到牛頓；物理學史上的畢達哥拉斯主義傳統(tǒng)；解讀狹義相對論的思想淵源；解讀廣義相對論的思想淵源等。

導言
第一章 新解近代科學革命：從伽利略、笛卡兒到牛頓
第一節(jié) 近代科學革命的頂峰
——牛頓經(jīng)典體系的三大核心
第二節(jié) 伽利略與牛頓、笛卡兒與牛頓的思想關聯(lián)對比
第三節(jié) 近代科學革命的“歷史異化”
第四節(jié) 近代科學革命的“歷史異化”的原因
第五節(jié) 小結
第二章 物理學史上的畢達哥拉斯主義傳統(tǒng)
第一節(jié) 畢達哥拉斯主義的起源
第二節(jié) 行星定律的發(fā)現(xiàn)
第三節(jié) 近代力學的建立
第四節(jié) 現(xiàn)代物理學中的畢達哥拉斯主義
第三章 解讀狹義相對論的思想淵源
第一節(jié)　狹義相對論的淵源：“靜止以太”與相對性原理不協(xié)調
第二節(jié)　愛因斯坦與洛倫茲及彭加勒的區(qū)別
第四章 解讀廣義相對論的思想淵源
第一節(jié) 廣義相對論的源流：等效原理、廣義協(xié)變性與馬赫原理
第二節(jié)  時空的相對性與絕對性、廣義相對性與協(xié)變性
第五章 海森伯與量子革命
第一節(jié) 慕尼黑：量子工程師驅駕的人才特別快車
第二節(jié) 哥廷根：量子數(shù)學家主宰的“數(shù)學王國”
第三節(jié) 哥本哈根：浸透著量子哲學家的精神
第四節(jié) 海森伯對于量子革命的特殊貢獻
第六章 玻爾互補性之真諦：一種量子力學的科學哲學
第一節(jié) 玻爾早年所受的哲學影響
第二節(jié) 互補性獨特的物理學內涵
第三節(jié) 互補性與一般辯證法的聯(lián)系
第四節(jié) 對羅森菲爾德的互補性解釋的再分析
第七章 因果／機遇或決定論／非決定論的兩極張力
——從玻爾、玻恩到玻姆
第一節(jié) 對尼耳斯·玻爾的因果觀分析的再分析
第二節(jié) 解讀馬克斯·玻恩的概率決定論思想
第三節(jié) 戴維·玻姆的量子勢因果解釋的解讀
第四節(jié) 卡爾·波普爾“物理非決定論’’的涵義辨析
第八章 充實的真空觀：量子場的實在論與生成辯證法
第一節(jié)  “場”對粒子而言將成為第一性的物理實在
第九章　再論量子場的實在論和生成辯證法
——從生成論與構成論對比的眼光看
第十章 EPR悖論、量子遠程關聯(lián)及其判決性實驗
——從邏輯的觀點看
第十一章 量子消相干等于還原論的終結嗎？
第十二章 規(guī)范場論的研究綱領述評
——按照畢達哥拉斯主義模式解讀
第十三章　關于弦論的哲學分析
第十四章　量子邏輯：一次全新的邏輯構造
附錄　量子引力的其他探索
參考文獻
后記