當(dāng)前，中國正處于整體逐步進(jìn)入工業(yè)現(xiàn)代化時(shí)代，并在部分地區(qū)和領(lǐng)域向知識經(jīng)濟(jì)跨越的混合發(fā)展階段，各種跨部門跨界的社會問題凸出，出現(xiàn)了越來越多的諸如社會治安、環(huán)境保護(hù)、食品安全等由單一的公共部門無力解決的公共事務(wù)。跨部門的社會事務(wù)和復(fù)雜的社會問題已經(jīng)向我們的政府提出了前所未有的挑戰(zhàn)，傳統(tǒng)的依靠議事協(xié)調(diào)機(jī)構(gòu)、等級制命令的協(xié)調(diào)機(jī)制與方式已經(jīng)越來越不能適應(yīng)時(shí)代的需求。政府部門通過什么形式和措施構(gòu)建"整體政府"解決跨部門協(xié)同的問題，已經(jīng)成為學(xué)界和政界關(guān)注的現(xiàn)實(shí)議題。《中國政府跨部門協(xié)同機(jī)制研究》的研究表明：盡管我國不乏跨部門協(xié)同機(jī)制，但是在實(shí)踐中協(xié)同的效果并不理想；而導(dǎo)致協(xié)同失靈的原因是多方面的，既有運(yùn)作層面技術(shù)理性的不足，也包括體制層面的制度缺陷；鑒于高層次制度決定著技術(shù)理性的發(fā)展限度，因此體制方面的問題更為重要。當(dāng)前，突破我國跨部門協(xié)同困境的關(guān)鍵在于實(shí)施制度變革，以基于規(guī)則和制度的協(xié)調(diào)與合作模型取代基于命令和控制的協(xié)調(diào)與合作模型，在改變行政觀念的基礎(chǔ)上，推動協(xié)同文化的產(chǎn)生，強(qiáng)化部門責(zé)任，借鑒整體政府的治理框架重新構(gòu)建適合中國國情的跨部門協(xié)同機(jī)制。