青海三江源區(qū)地處青藏高原，是長江、黃河、瀾滄江的發(fā)源地，是重要的水源涵養(yǎng)生態(tài)功能區(qū)，為全國乃至東亞地區(qū)提供了重要的淡水資源，被譽為“中華水塔”；三江源區(qū)是我國最重要的生物多樣性資源寶庫和最重要的遺傳基因庫之一，具有強大的生物多樣性，保育功能，為眾多的珍稀瀕危動植物提供了生存場所，有“高寒生物自然種質(zhì)資源庫”之稱：三江源區(qū)是全球氣候變化的敏感區(qū)，對全國乃至全球的大氣、水量循環(huán)具有重大影響：三江源區(qū)還是我國國家生態(tài)保護綜合試驗區(qū)，是中華民族的重要生態(tài)屏障。因此，三江源區(qū)的生態(tài)戰(zhàn)略地位極為特殊，也極為重要。十八大以來黨中央將生態(tài)文明建設(shè)提到前所未有的高度，三江源區(qū)生態(tài)保護在國家生態(tài)文明建設(shè)布局中具有重要的戰(zhàn)略地位。
　　生態(tài)補償以保護生態(tài)環(huán)境、促進人與自然和諧發(fā)展為目的，它作為調(diào)整生態(tài)環(huán)境保護和建設(shè)相關(guān)者之間利益關(guān)系的環(huán)境經(jīng)濟手段，在世界范圍內(nèi)得到了廣泛的應用o三江源區(qū)自然條件嚴酷、地域廣闊、人口稀少，以畜牧生產(chǎn)為主要產(chǎn)業(yè)，經(jīng)濟發(fā)展相對欠發(fā)達，人民生活水平較低。三江源區(qū)生態(tài)系統(tǒng)敏感脆弱，一旦遭到破壞極難恢復。三江源區(qū)生態(tài)保護造成了該區(qū)人口、資源與環(huán)境之間的矛盾極為突出。三江源區(qū)為維護國家生態(tài)安全和中下游發(fā)展做出了巨大貢獻和犧牲，構(gòu)建長效生態(tài)補償機制是維護三江源區(qū)生態(tài)功能的關(guān)鍵。
　　隨著氣候變化及人類活動的干擾，三江源區(qū)的生態(tài)環(huán)境不斷惡化。為了更好地保護三江源區(qū)生態(tài)環(huán)境，制定更為科學合理的三江源區(qū)生態(tài)補償政策，2011年7月28日，青海省人民政府與中國工程院簽署科技合作協(xié)議，并于2012年1月啟動實施重點項目“三江源區(qū)生態(tài)補償長效機制研究”。